近日,,我校李鈞敏教授國際合作團隊在知名期刊《Horticulture Research》(中科院一區(qū)TOP,五年影響因子8.2,,入選中國科技期刊卓越行動計劃領(lǐng)軍類期刊)上在線發(fā)表題為“Genomic data provides insights into the evolutionary history and adaptive differentiation of two tetraploid strawberries”的研究論文,,團隊林漢揚副教授為論文第一作者,李鈞敏教授為通訊作者,,臺州學(xué)院為第一單位,。
多倍體植物與其二倍體祖先間的生態(tài)位進化式樣及其遺傳背景是生態(tài)學(xué)領(lǐng)域長期關(guān)注的議題。該論文以薔薇科草莓屬(Fragaria)植物為研究對象,,組裝了傘房草莓等五種野生草莓的染色體級別全基因組,,聚焦兩個我國特有的四倍體物種傘房草莓(F. corymbosa)和西南草莓(F. moupinensis)開展了相關(guān)研究。全基因組數(shù)據(jù)顯示,,二倍體中國草莓是四倍體傘房草莓最有可能的祖先,,而四倍體西南草莓的祖先可能是未被采樣的中國草莓群體或已滅絕的中國草莓近緣物種;同時,,二倍體草莓物種間存在廣泛的基因漸滲。結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),,該研究發(fā)現(xiàn)四倍體物種較之其二倍體祖先在與紫外線輻射,、DNA修復(fù)等相關(guān)基因中呈現(xiàn)出基因家族擴張和轉(zhuǎn)錄水平上升,,而在與各類脅迫響應(yīng)相關(guān)的基因中顯示出基因家族收縮和轉(zhuǎn)錄水平下降,為該熱點議題提供了重要的分子遺傳學(xué)啟示,。
該項研究得到了國家自然科學(xué)基金委員會(NSFC)與美國國家科學(xué)基金會(NSF)中美生物多樣性專項的資助,。美國匹茲堡大學(xué)Tia-Lynn Ashman教授、美國俄勒岡州立大學(xué)Aaron Liston教授,、杭州師范大學(xué)董鳴教授等參與指導(dǎo)了該項研究,。
論文鏈接:https://doi.org/10.1093/hr/uhae194